Через базу данных - phpMyAdmin - проще всего. Выбираете в таблице префикс_users, по умолчанию dle_users, выделяете всех, кроме себя (айди1) и жмёте Удалить.
Ещё как вариант - открыть файл index.php, там найти строку:
require_once ROOT_DIR . '/engine/init.php';
и добавить:
$db->query("DELETE FROM ".USERPREFIX."_users WHERE id!=1");
После чего перейти на любую страницу сайта, данный запрос очистит всех пользователей кроме админа. Строку эту потом надо удалить.